La MDPH est organisée autour de trois instances décisionnelles complémentaires :
• la Commission Exécutive COMEX (gestion stratégique),
• la Commission des Droits et de l’Autonomie des Personnes Handicapées CDAPH (Gestion des droits)
• et le Comité de gestion du Fonds départemental de compensation du handicap (Gestion des aides sociales).
 
La MDPH est située à Saint-Denis et à Saint-Pierre :
• Le siège : n°13 rue Fénelon à Saint-Denis.
La MDPH partage ses locaux à Saint-Denis avec le GIP SAP La maison de l’aide à la personne.
• Antenne sud : 13 rue Archambaud - Immeuble MONDEO au centre-ville à Saint-Pierre.
La plateforme baptisée "handispace" est partagée avec le pôle handicap du CCAS de la ville de Saint-Pierre.
 
Pour mener à bien sa mission de service public, la MDPH dispose également d’un service d’accueil téléphonique avec un NUMERO VERT unique 0800 000 262.
 
L’équipe MDPH est composée de professionnels aux domaines divers de compétences (accueil, assistance administrative, évaluation pluridisciplinaire, gestion comptable, logistique, informatique …).
 
L’organisation de la MDPH redéfinie en 2010 s’appuie sur le principe d’une territorialisation des compétences pour mieux répondre aux attentes des usagers et de ses partenaires.